بیماری‌های نادر

پنل‌های جهش بیماری‌های نادر و تحلیل توالی کل اگزوم (WES)

بیماری‌های نادر طبق تعریف اروپا و سایر کشورهای توسعه‌یافته، بیماری‌هایی هستند که در ۱ نفر از هر ۲۰۰۰ نفر یا کمتر دیده می‌شوند و اکثر آن‌ها پیشرونده، متابولیک، مزمن و برخی کشنده هستند.

  • در ادبیات پزشکی حدود ۸۰۰۰ بیماری نادر شناسایی شده و ۸۰٪ این بیماری‌ها ژنتیکی هستند.
  • حدود ۵۰٪ بیماران را کودکان تشکیل می‌دهند.
  • ۳۰٪ کودکان مبتلا به بیماری نادر ۵ سالگی را نمی‌بینند. دلیل اصلی: ۹۵٪ بیماری‌های نادر درمان ندارند.
  • در ترکیه، بیماری نادر از هر ۱۶ نفر ۱ نفر را مبتلا می‌کند؛ ۵ میلیون نفر در ترکیه و حدود ۳۵۰ میلیون نفر در جهان مبتلا به بیماری نادر هستند.
  • هر بیماری ویژگی‌های خاص خود را دارد. بنابراین به روش‌های مراقبتی و درمانی خاص، دارو، مواد مصرفی، غذاهای ویژه و تجهیزات پزشکی نیاز است.
  • اگرچه بیماری‌ها نادر هستند، نتایج آن‌ها هم برای فرد مبتلا، هم برای خانواده و هم برای جامعه بسیار سنگین است.

پنل جهش نوروفیبروماتوزیس

نوروفیبروماتوزیس (NF) مجموعه‌ای از بیماری‌های ژنتیکی است که باعث رشد تومور در امتداد اعصاب مختلف شده و علاوه بر آن بر رشد بافت‌های غیرعصبی مانند استخوان و پوست تأثیر می‌گذارد.

NF1 NF2

پنل جهش ژن دیستروفین

دیستروفی عضلانی دوشن (DMD) شایع‌ترین بیماری عضلانی است. از آنجا که بر اثر حذف در ژن دیستروفین روی کروموزوم X ایجاد می‌شود، از هر ۳۵۰۰ نوزاد پسر یک نفر مبتلا می‌شود.

DMD

پنل جهش فیبروز کیستیک

فیبروز کیستیک (CF) با توالی‌یابی کل ژن بررسی می‌شود.

CFTR

پنل اسکلروز توبولر

این بیماری بیشتر در پوست، مغز و کلیه‌ها لکه‌هایی (هامارتوم/نوعی تومور خوش‌خیم) ایجاد می‌کند. برخی علائم هنگام تولد وجود ندارند و بعد ظاهر می‌شوند.

TSC1 TSC2

پنل جهش بیماری‌های ذخیره لیزوزومی

بیماری‌های لیزوزومی گروهی از بیماری‌های ارثی هستند که ده‌ها هزار نفر را در سراسر جهان تحت تأثیر قرار می‌دهند. هر نیم ساعت یک کودک مبتلا به بیماری لیزوزومی متولد می‌شود.

GALC NAGA MANBA SMPD1 GLB1 GBA2 GBA HEXB HEXA GNPTAB GUSB ARSA ARSB FUCA1 MAN2B1

پنل جهش سندرم نونان

سندرم نونان (NS) یک بیماری ژنتیکی چندسیستمیک اتوزومال غالب با شیوع حدود ۱/۲۵۰۰ است. حدود ۵۰٪ موارد ناشی از جهش‌های ژن PTPN11 هستند.

A2ML1 PTPN11 BRAF CBL HRAS KRAS NRAS MAP2K1 MAP2K2 RAF1 RIT1 SHOC2 SOS1 SPRED1

پنل جهش بیماری ذخیره گلیکوژن

نوع ۱ GSD از نظر بالینی شدیدترین نوع است. بیماران در دوره شیرخوارگی با هیپوگلیسمی، اسیدوز، تأخیر رشد و هپاتومگالی مراجعه می‌کنند.

PHKG2 PHKA2 GYS2 G6PC SLC37A4 AGL GBE1 PYGM GYS1 GAA PRKAG2 PYGL GYG1 PGM1 PHKA1 PHKB PGAM2 PFKM ENO3 ALDOA LAMP2

پنل جهش کاردیومیوپاتی هیپرتروفیک

کاردیومیوپاتی هیپرتروفیک بیماری ارثی (اتوزومال غالب) با طیف وسیعی از علائم از بدون علامت تا غش و حملات سنکوپ است. از آنجا که خطر مرگ ناگهانی در دوران کودکی بالاتر است، تشخیص زودهنگام بسیار مهم‌تر است.

ACTA2 ACTC1 ACTN2 CALR3 CAV1 CAV3 PRKAG2 SLC2A11 SLC52A2 SLC6A2 SLC12A3 SLC19A2 SLC25A4 SLC22A5 SLC25A20 SLC2A10 TNNC1 TNNI3 TNNT2

پنل LQT

سندرم QT طولانی بیماری نادری است که با اختلال بازپلاریزاسیون میوکارد بدون ناهنجاری ساختاری قلب مشخص شده و خطر مرگ ناگهانی نوزاد را افزایش می‌دهد. فراوانی آن ۱/۲۵۰۰-۷۰۰۰ تخمین زده می‌شود.

SCN5A KCNH2 KCNQ1 KCNE2 KCNE1

پنل جهش اختلال گلیکوزیلاسیون

اختلال گلیکوزیلاسیون یک وضعیت ارثی است که بسیاری از بخش‌های بدن را تحت تأثیر قرار می‌دهد. افراد مبتلا معمولاً علائم را در دوران شیرخوارگی توسعه می‌دهند.

ALG1 ALG2 ALG3 ALG6 ALG8 ALG9 ALG12 ALG13 B4GALT1 COG1 COG4 COG5 COG6 COG7 COG8 DOLK DPAGT1 DPM1 DPM3 MGAT2 MOGS MPDU1 MPI PMM2 RFT1 SLC35A1 SLC35C1

پنل جهش کاهش شنوایی ارثی

فراوانی کاهش شنوایی به‌طور کلی ۱ در ۱۰۰۰ تولد زنده تعیین شده است. حدود نیمی از این عدد به دلایل ژنتیکی و نیم دیگر به دلایل محیطی مربوط می‌شود.

COL11A1 COL11A2 COL2A1 COL4A3 COL4A4 COL4A5 COL9A1 COL9A2 DFNA5 MYO15A MYO1A MYO3A MYO6 MYO7A DFNB31 DFNB59 GJB2 GJB3 GJB6 KCNQ1 KCNQ4 MYH14 MYH9 SERPINB6 SLC17A8 SLC26A4 SLC26A5 SLC4A11

پنل جهش سندرم‌های تب دوره‌ای

اکثریت ۳۰ جهش شناخته‌شده در اگزون ۱۰ قرار دارند. تفاوت‌های فنوتیپی با جهش‌ها مرتبط هستند. جهش M694V با فنوتیپ شدیدتر و خطر بالای آمیلوئیدوز مرتبط است.

MEFV TNFRSF1A NLRP3 MVK NOD2 IL1RN IL10RA IL10RB IL10 PSTPIP1 LPIN2 PLCG2

پنل جهش باردت-بیدل

سندرم باردت-بیدل (BBS) بیماری ژنتیکی ناهمگن است که با چاقی، دیستروفی شبکیه، پلی‌داکتیلی، ناهنجاری‌های کلیوی، عقب‌ماندگی ذهنی و هیپوگنادیسم مشخص می‌شود.

CCDC28B BBS1 BBS2 BBS10 ARL6 MKKS BBS9 MKS1

پنل جهش دیستروفی عضلانی لیمب‌گیردل

دیستروفی عضلانی لیمب‌گیردل بیماری اتوزومال غالب است. این بیماری پس از جهش در ژن‌های MYOT، LMNA، CAV3 و DNAJB6 که پروتئین‌های عضله اسکلتی را کد می‌کنند، ایجاد می‌شود.

CAPN3 SGCB SGCA FKRP POMGNT1 DNAJB6 DYSF POMT1 FKTN

پنل جهش آتاکسی اسپینوسره‌بلر

آتاکسی اسپینوسره‌بلر (SCA) بیماری است که بر اثر از دست رفتن یا اختلال عملکرد سلول‌های تعادلی در مخچه و نخاع ایجاد می‌شود.

ATXN7 ATXN1 ATXN10 CACNA1A ATXN3 PPP2R2B ATXN2 TBP STUB1 ELOVL4 SETX KCND3 SPTBN2

پنل جهش سندرم آلپورت

سندرم آلپورت به‌صورت اتوزومال مغلوب، اتوزومال غالب یا وابسته به X مغلوب به ارث می‌رسد. در ۸۰٪ بیماران جهش‌های COL4A5 وابسته به X مشاهده شده است.

COL4A5 COL4A4 COL4A3

پنل جهش سندرم کالمن

سندرم کالمن یکی از مهم‌ترین دلایل ناباروری مردان است. با هیپوگنادیسم هیپوگنادوتروپیک و آنوزمیا (عدم توانایی بویایی) همراه است.

KAL1 KAL2 XLR RROKR2 PROK2 STS GNRH1

پنل نارسایی زودرس تخمدان

نارسایی زودرس تخمدان (POI) وضعیتی است که با آمنوره قبل از ۴۰ سالگی، سطح بالای گونادوتروپین و کاهش سطح استروژن مشخص می‌شود. شیوع آن حدود ۱٪ زنان زیر ۴۰ سال است.

FSHR FIGLA INHA GDF9 NOBOX NR5A1 PDPK1 BMP15 POF1B

ناباروری زنانه

شایع‌ترین دلیل ژنتیکی: ناهنجاری‌های کروموزومی و جهش‌های ژن FMR1 روی کروموزوم X مسئول سندرم X شکننده هستند.

FSHB FSHR LHBB LHCGR

ناباروری مردانه

دلایل اصلی ناباروری مردانه: ناهنجاری‌های کروموزومی بزرگ، میکرودلشن کروموزوم Y، فیبروز کیستیک، اختلالات هورمونی و برخی سندرم‌های ژنتیکی نادر.

AZFa: sY86, sY625, M259 / AZFb: sY131, sY127, sY134 / AZFc: sY255, sY157, sY254 — کنترل: ZFY/ZFX, sY14 (SRY), sY81, sY90

CATSPER1 CFTR LHCGR

پنل جهش MODY — ۱

GCK HNF1A HNF1B HNF4A

پنل جهش MODY — ۲

ABCC8 BLK FOXP3 G6PC2 GCK GLIS3 HNF1A HNF1B HNF4A INS PDX1 INSR KCNJ11 KLF11 NEUROD1 NEUROG3 NKX2-2 PAX4 RFX6 ZFP57 HADH GLUD1 SLC16A1

تحلیل توالی کل ژن CFTR

در بیماران فیبروز کیستیک، cAMP از سلول‌های اپیتلیال قادر به ترشح نیست. در نتیجه، عرق حاوی نمک زیاد، بیماری‌های مزمن ریوی و نارسایی پانکراس ظاهر می‌شود. ۹۷-۹۸٪ مردان مبتلا به فیبروز کیستیک آزواسپرمی ناشی از فقدان مادرزادی دوطرفه واز deferens (CBAVD) دارند.

CFTR

تحلیل توالی MEFV

تب مدیترانه‌ای خانوادگی (FMF): بیماری ارثی (اتوزومال مغلوب) با حملات تب مکرر، درد شکم (پریتونیت)، درد سینه (پلوریت) و درد و تورم مفاصل (آرتریت).

جهش‌های عامل بیماری معمولاً در اگزون‌های ۲ و ۱۰ ژن یافت می‌شوند.

MEFV

تحلیل توالی کانکسین

افرادی که جهش c.35delG در ژن GJB2 دارند، کاهش شنوایی خانوادگی و بین خانواده‌ای دارند. کاهش شنوایی با شیوع ۱-۲ در ۱۰۰۰ نوزاد شایع‌ترین اختلال حسی است.

GJB2

تحلیل قطعه X شکننده

سندرم X شکننده شایع‌ترین علت ارثی عقب‌ماندگی ذهنی و مشکلات یادگیری است. ناشی از افزایش تکرار CGG در ژن FMR1 روی کروموزوم X است.

FMR1

پنل جهش DNA میتوکندریایی

MtDNA (whole gene)

خدمات توالی‌یابی کل اگزوم (WES) ما

برای اطلاعات دقیق درباره خدمات Whole Exome Sequencing، روند کار و نحوه درخواست به westesti.com مراجعه کنید.

به westesti.com بروید

تحلیل توالی کل اگزوم (WES)

آزمون تحلیل توالی کل اگزوم (Whole Exome Sequencing — WES) چیست؟

DNA شامل حدود ۲۰,۰۰۰ ژن است. توالی‌های کدکننده پروتئین هر ژن اگزون نامیده می‌شوند؛ مجموع تمام اگزون‌ها روی DNA اگزوم نامیده می‌شود. حدود ۸۵٪ بیماری‌های ژنتیکی انسانی ناشی از تغییرات مختلف در نواحی اگزون هستند. بنابراین، توالی‌یابی این نواحی که فقط حدود ۱٪ DNA را تشکیل می‌دهند، اهمیت تشخیصی بالایی دارد.

تحلیل توالی کل اگزوم برای چه کسانی باید انجام شود؟

  • موارد پیچیده‌ای که تشخیص افتراقی با یافته‌های بالینی امکان‌پذیر نیست
  • مواردی که آزمون‌های خط اول نتیجه طبیعی نداده‌اند
  • تشخیص اختلالات ناهمگن ژنتیکی و فنوتیپی
  • خانواده‌هایی که فرزند بیمار دارند و بارداری جدید برنامه‌ریزی می‌کنند

مزایای آزمون تحلیل توالی کل اگزوم چیست؟

نرخ تشخیص بسته به گروه بین ۳۰-۸۰٪ متغیر است. آزمون WES مشارکت تشخیصی مهمی برای این بیماری‌ها فراهم می‌کند.

با تعیین علت بیماری، امکانات درمانی باید دوباره ارزیابی شوند. همچنین در بارداری‌های احتمالی خانواده، احتمال عود مشخص می‌شود.