Seltene Erkrankungen

Mutationspanels für seltene Erkrankungen und Whole Exome Sequencing (WES)

Seltene Erkrankungen sind laut der Definition in Europa und anderen entwickelten Ländern Krankheiten, die bei 1 von 2000 oder weniger Personen auftreten, von denen die meisten fortschreitend, metabolisch, chronisch und einige tödlich sein können.

  • In der Literatur sind etwa 8000 seltene Erkrankungen beschrieben, von denen 80 % genetisch bedingt sind.
  • Etwa 50 % der Patienten sind Kinder.
  • 30 % der Kinder mit seltenen Erkrankungen erleben nicht ihren 5. Geburtstag. Der Hauptgrund: 95 % der seltenen Erkrankungen haben keine Behandlung.
  • In der Türkei betrifft eine seltene Erkrankung 1 von 16 Personen; 5 Millionen in der Türkei und weltweit etwa 350 Millionen Menschen leben mit einer seltenen Erkrankung.
  • Jede Krankheit hat ihre eigenen Merkmale. Daher werden spezielle Pflege- und Behandlungsmethoden, Medikamente, Verbrauchsmaterialien, Spezialnahrungsmittel und medizinische Geräte benötigt.
  • Auch wenn die Krankheiten selten sind, sind die Ergebnisse sowohl für das betroffene Individuum als auch für seine Familie und die Gesellschaft sehr schwerwiegend.

Neurofibromatose-Mutationspanel

Neurofibromatose (NF) ist eine Gruppe genetischer Erkrankungen, die das Wachstum von Tumoren entlang verschiedener Nerven verursacht und zusätzlich die Entwicklung von nicht-neuralen Geweben wie Knochen und Haut beeinflusst. NF verursacht Tumorwachstum überall im Körper und führt auch zu Entwicklungsanomalien.

Neurofibromatose 1 (NF1), auch als von Recklinghausen NF oder periphere NF bekannt, tritt bei 1 von 4000 Geburten auf. Sie ist durch Café-au-lait-Flecken auf der Haut und subkutane Neurofibrome gekennzeichnet. Knochenerweiterungen und -deformationen sowie Wirbelsäulenverkrümmung (Skoliose) können ebenfalls auftreten. Neurofibromatose 2 (NF2), auch als bilaterale akustische NF (BAN) bekannt, ist seltener und tritt bei 1 von 40.000 Geburten auf. NF2 ist durch multiple Tumoren an kranialen und spinalen Nerven gekennzeichnet.

NF1 NF2

Dystrophin-Gen-Mutationspanel

Duchenne-Muskeldystrophie (DMD) ist die häufigste Muskelerkrankung. Da sie durch Deletionen im Dystrophin-Gen auf dem X-Chromosom verursacht wird, tritt sie bei 1 von 3500 Jungen auf. Bei dieser Erkrankung fehlt ein für die Muskelfunktion wesentliches Protein.

Ohne dieses Protein werden die Muskeln zunehmend schwächer und Muskelgewebe wird durch Fettgewebe ersetzt. Die Diagnose wird häufig im Alter von 2-5 Jahren gestellt. Die Schwäche beginnt um Hüften und Schultern und schreitet voran; die Kinder verlieren im Durchschnitt im Alter von 9-11 Jahren die Gehfähigkeit.

DMD

Mukoviszidose-Mutationspanel

Mukoviszidose (CF) wird durch Whole-Gen-Sequenzierung untersucht.

CFTR

Tuberöse Sklerose-Panel

Diese Erkrankung verursacht am häufigsten Flecken (Hamartome/Arten gutartiger Tumoren) in allen Organen, insbesondere in Haut, Gehirn und Nieren. Einige Symptome sind bei der Geburt nicht vorhanden und treten später auf.

TSC1 TSC2

Lysosomale Speicherkrankheiten-Mutationspanel

Lysosomale Erkrankungen sind eine Gruppe von Erbkrankheiten, die weltweit Zehntausende von Menschen betreffen. Die Mehrheit der Patienten sind Kinder. Alle 30 Minuten wird ein Kind mit einer lysosomalen Erkrankung geboren. Wie bei anderen Erbkrankungen werden diese Krankheiten von den Eltern an die Kinder weitergegeben.

Mukopolysaccharidosen haben trotz der Ursache in verschiedenen Genen ein gemeinsames Merkmal: Die Vererbung erfolgt autosomal-rezessiv. Das bedeutet, dass für das Auftreten der Krankheit beim Kind beide Elterngene den krankheitsverursachenden Defekt aufweisen müssen.

GALC NAGA MANBA SMPD1 GLB1 GBA2 GBA HEXB HEXA GNPTAB GUSB ARSA ARSB FUCA1 MAN2B1

Noonan-Syndrom-Mutationspanel

RASopathien sind eine Gruppe von Krankheiten, die das Nervensystem, das Herz-Kreislauf-System und die Haut betreffen und dysmorphe Gesichtszüge verursachen. Das Noonan-Syndrom (NS) ist eine autosomal-dominante genetische Multisystemerkrankung mit einer Prävalenz von etwa 1/2500. Fälle werden zu etwa 50 % durch PTPN11-Gen-Mutationen verursacht.

A2ML1 PTPN11 BRAF CBL HRAS KRAS NRAS MAP2K1 MAP2K2 RAF1 RIT1 SHOC2 SOS1 SPRED1

Glykogenspeicherkrankheit-Mutationspanel

Typ 1 GSD ist klinisch der schwerste Typ. Patienten zeigen im Säuglingsalter Hypoglykämie, Azidose, Wachstumsverzögerung und Hepatomegalie. Besonders bei Typ 1 können sich bei Patienten über 10 Jahren hepatozelluläre Adenome entwickeln.

Typ 2: Das GAA-Gen befindet sich auf dem q25.2-q25.3-Locus von Chromosom 17. Mutationen in diesem Gen verursachen die Pompe-Krankheit.

PHKG2 PHKA2 GYS2 G6PC SLC37A4 AGL GBE1 PYGM GYS1 GAA PRKAG2 PYGL GYG1 PGM1 PHKA1 PHKB PGAM2 PFKM ENO3 ALDOA LAMP2

Hypertrophe Kardiomyopathie-Mutationspanel

Hypertrophe Kardiomyopathie ist eine familiäre (autosomal-dominant vererbte) Erkrankung mit einem breiten Spektrum von Symptomen von asymptomatisch bis zu Bewusstlosigkeit und Ohnmachtsanfällen. Da das Risiko eines plötzlichen Todes im Kindesalter höher ist, ist die frühzeitige Diagnose besonders wichtig.

ACTA2 ACTC1 ACTN2 CALR3 CAV1 CAV3 PRKAG2 SLC2A11 SLC52A2 SLC6A2 SLC12A3 SLC19A2 SLC25A4 SLC22A5 SLC25A20 SLC2A10 TNNC1 TNNI3 TNNT2

LQT-Panel

Das Long-QT-Syndrom ist eine seltene Erkrankung, die durch myokardiale Repolarisationsstörung ohne strukturelle Herzfehler gekennzeichnet ist und das Risiko des plötzlichen Kindstodes erhöht. Die Häufigkeit des kongenitalen Long-QT-Syndroms wird auf 1/2500-7000 geschätzt.

SCN5A KCNH2 KCNQ1 KCNE2 KCNE1

Glykosylierungsstörungen-Mutationspanel

Glykosylierungsstörung ist eine erbliche Erkrankung, die viele Körperteile betrifft. Betroffene Personen entwickeln typischerweise Symptome im Säuglingsalter. Sie können Schwierigkeiten haben, Gewicht zuzunehmen und in der erwarteten Rate zu wachsen. Betroffene Säuglinge haben typischerweise einen schwachen Muskeltonus (Hypotonie) und Entwicklungsverzögerungen.

ALG1 ALG2 ALG3 ALG6 ALG8 ALG9 ALG12 ALG13 B4GALT1 COG1 COG4 COG5 COG6 COG7 COG8 DOLK DPAGT1 DPM1 DPM3 MGAT2 MOGS MPDU1 MPI PMM2 RFT1 SLC35A1 SLC35C1

Hereditärer Hörverlust-Mutationspanel

Die Häufigkeit von Hörverlust wird im Allgemeinen bei 1 von 1000 Lebendgeburten festgestellt. Etwa die Hälfte dieser Zahl ist auf genetische Ursachen und die andere Hälfte auf Umweltursachen zurückzuführen.

COL11A1 COL11A2 COL2A1 COL4A3 COL4A4 COL4A5 COL9A1 COL9A2 DFNA5 MYO15A MYO1A MYO3A MYO6 MYO7A DFNB31 DFNB59 GJB2 GJB3 GJB6 KCNQ1 KCNQ4 MYH14 MYH9 SERPINB6 SLC17A8 SLC26A4 SLC26A5 SLC4A11

Periodisches Fiebersyndrom-Mutationspanel

Die Mehrheit der bisher bekannten 30 Mutationen befindet sich in Exon 10. Die phänotypischen Unterschiede bei der Krankheit hängen mit den Mutationen zusammen, daher wird die Genotyp-Phänotyp-Korrelation intensiv untersucht.

Die M694V-Mutation ist mit einem schwereren Phänotyp und einem höheren Amyloidose-Risiko verbunden. Die V726A-Mutation ist mit einem geringeren Amyloidose-Risiko verbunden. Die E148Q-Mutation ist mit dem mildesten Phänotyp assoziiert.

MEFV TNFRSF1A NLRP3 MVK NOD2 IL1RN IL10RA IL10RB IL10 PSTPIP1 LPIN2 PLCG2

Bardet-Biedl-Mutationspanel

Das Bardet-Biedl-Syndrom (BBS) ist eine genetisch heterogene Erkrankung, die durch Fettleibigkeit, retinale Dystrophie, Polydaktylie, Nierenmalformationen, geistige Behinderung und Hypogonadismus gekennzeichnet ist.

CCDC28B BBS1 BBS2 BBS10 ARL6 MKKS BBS9 MKS1

Limb-Girdle-Muskeldystrophie-Mutationspanel

Limb-Girdle-Muskeldystrophie ist eine autosomal-dominant vererbte Erkrankung. Die Erkrankung entwickelt sich nach Mutationen in den MYOT-, LMNA-, CAV3- und DNAJB6-Genen, die Skelettmuskelproteine kodieren.

CAPN3 SGCB SGCA FKRP POMGNT1 DNAJB6 DYSF POMT1 FKTN

Spinocerebelläre Ataxie-Mutationspanel

Spinocerebelläre Ataxie (SCA) ist eine Erkrankung, die durch Gleichgewichtsstörungen infolge des Verlusts oder der Funktionsstörung von Gleichgewichtszellen im Kleinhirn und Rückenmark entsteht.

ATXN7 ATXN1 ATXN10 CACNA1A ATXN3 PPP2R2B ATXN2 TBP STUB1 ELOVL4 SETX KCND3 SPTBN2

Alport-Syndrom-Mutationspanel

Das Alport-Syndrom wird autosomal-rezessiv, autosomal-dominant oder X-chromosomal-rezessiv vererbt. Bei 80 % der Patienten werden X-chromosomal vererbte COL4A5-Mutationen beobachtet.

COL4A5 COL4A4 COL4A3

Kallmann-Syndrom-Mutationspanel

Das Kallmann-Syndrom ist eine der wichtigsten Ursachen für männliche Infertilität. Es wird zusammen mit Hypogonadotropem Hypogonadismus und Anosmie (Unfähigkeit zu riechen) beobachtet.

KAL1 KAL2 XLR RROKR2 PROK2 STS GNRH1

Vorzeitige Ovarialinsuffizienz-Panel

Vorzeitige Ovarialinsuffizienz (POI) ist ein Zustand, der durch Amenorrhoe vor dem 40. Lebensjahr, erhöhte Gonadotropinspiegel und daraus resultierende niedrige Östrogenspiegel gekennzeichnet ist.

Die Prävalenz liegt bei etwa 1 % der Frauen unter 40 Jahren, 0,1 % der Frauen unter 30 Jahren und 0,01 % der Frauen unter 20 Jahren.

FSHR FIGLA INHA GDF9 NOBOX NR5A1 PDPK1 BMP15 POF1B

Weibliche Infertilität

Die häufigste genetische Ursache sind chromosomale Anomalien und Mutationen im FMR1-Gen auf dem X-Chromosom, die für das Fragile-X-Syndrom verantwortlich sind.

FSHB FSHR LHBB LHCGR

Männliche Infertilität

Die Hauptursachen für männliche Infertilität sind: schwere chromosomale Anomalien, Y-Chromosom-Mikrodeletionen, Mukoviszidose, hormonelle Störungen und einige seltene genetische Syndrome.

AZFa: sY86, sY625, M259 / AZFb: sY131, sY127, sY134 / AZFc: sY255, sY157, sY254 — Kontrolle: ZFY/ZFX, sY14 (SRY), sY81, sY90

CATSPER1 CFTR LHCGR

MODY-Mutationspanel — 1

GCK HNF1A HNF1B HNF4A

MODY-Mutationspanel — 2

ABCC8 BLK FOXP3 G6PC2 GCK GLIS3 HNF1A HNF1B HNF4A INS PDX1 INSR KCNJ11 KLF11 NEUROD1 NEUROG3 NKX2-2 PAX4 RFX6 ZFP57 HADH GLUD1 SLC16A1

CFTR Whole-Gen-Sequenzanalyse

Bei Mukoviszidose-Patienten kann zyklisches AMP aus Epithelzellen nicht ausgeschieden werden. Infolgedessen entwickeln sich Schweiß mit hohem Salzgehalt, chronische Lungenerkrankungen und Pankreasinsuffizienz. 97-98 % der Männer mit Mukoviszidose haben Azoospermie aufgrund bilateralen kongenitalen Fehlens des Vas deferens (CBAVD).

CFTR

MEFV-Sequenzanalyse

Familiäres Mittelmeerfieber (FMF): Eine genetisch vererbte (autosomal-rezessive) Erkrankung mit wiederkehrenden Fieber-, Bauchschmerzen- (Peritonitis), Brustschmerzen- (Pleuritis) und Gelenkschmerzattacken.

Die krankheitsverursachenden Mutationen befinden sich häufig in den Exons 2 und 10 des Gens.

MEFV

Connexin-Sequenzanalyse

Personen mit der c.35delG-Mutation im GJB2-Gen weisen Hörverlust innerhalb und zwischen Familien auf. Hörverlust mit einer Inzidenz von 1-2 pro 1000 Neugeborenen ist die häufigste sensorische Störung.

GJB2

Fragiles-X-Fragmentanalyse

Das Fragile-X-Syndrom ist die häufigste erbliche Ursache von Intelligenzminderung und Lernschwierigkeiten. Es wird durch eine CGG-Repeat-Expansion im FMR1-Gen auf dem X-Chromosom verursacht.

FMR1

Mitochondriale DNA-Mutationspanel

MtDNA (whole gene)

Unsere Whole Exome Sequencing (WES)-Leistung

Ausführliche Informationen zu unserer Whole Exome Sequencing-Leistung, zum Ablauf und zur Antragstellung finden Sie auf westesti.com.

Zu westesti.com

Whole Exome Sequencing (WES)

Was ist der Whole Exome Sequencing (WES)-Test?

Die DNA enthält etwa 20.000 Gene. Die protein-kodierenden Sequenzen jedes Gens werden Exon genannt; die Gesamtheit aller Exons auf der DNA wird als Exom bezeichnet. Etwa 85 % der menschlichen genetischen Erkrankungen werden durch verschiedene Arten von Veränderungen in den Exon-Regionen verursacht. Daher hat die Sequenzierung dieser Regionen, die nur etwa 1 % der DNA ausmachen, eine große diagnostische Bedeutung.

Bei wem sollte die WES-Analyse durchgeführt werden?

  • Komplexe Fälle, bei denen keine Differenzialdiagnose möglich ist
  • Fälle, bei denen Erstlinientests keine normalen Ergebnisse lieferten
  • Diagnose genetisch und phänotypisch heterogener Störungen
  • Familien mit einem erkrankten Kind, die eine neue Schwangerschaft planen

Welche Vorteile bietet der WES-Test?

Die Diagnoseraten variieren je nach Gruppe zwischen 30-80 %. Der WES-Test leistet einen bedeutenden diagnostischen Beitrag für diese Krankheiten, von denen viele selten sind.

Durch die Identifizierung der Krankheitsursache müssen die Behandlungsmöglichkeiten erneut bewertet werden. Darüber hinaus werden bei möglichen Schwangerschaften der Familie die Rezidivwahrscheinlichkeiten geklärt.