Sëmundjet e rralla

Panelet e mutacioneve të sëmundjeve të rralla dhe analiza e sekuencës së plotë të ekzomës (WES)

Sëmundjet e rralla, sipas përkufizimit në Evropë dhe vendet e tjera të zhvilluara, janë sëmundje që shfaqen tek 1 në 2000 persona ose më rrallë, shumica prej të cilave janë progresive, metabolike, kronike dhe disa mund të jenë fatale.

  • Në literaturë janë përcaktuar rreth 8000 sëmundje të rralla dhe 80% e këtyre sëmundjeve janë gjenetike.
  • Rreth 50% e pacientëve janë fëmijë.
  • 30% e fëmijëve me sëmundje të rralla nuk e shohin moshën 5-vjeçare. Arsyeja kryesore: 95% e sëmundjeve të rralla nuk kanë trajtim.
  • Sëmundjet e rralla shfaqen tek 1 në çdo 16 persona në Turqi; 5 milionë në Turqi dhe rreth 350 milionë në botë kanë një sëmundje të rrallë.
  • Çdo sëmundje ka karakteristikat e veta. Për këtë arsye nevojiten metoda të veçanta kujdesi dhe trajtimi, ilaçe, materiale harxhuese, ushqime të veçanta dhe pajisje mjekësore.
  • Edhe pse sëmundjet janë të rralla, pasojat janë shumë të rënda si për individin e sëmurë, ashtu edhe për familjen dhe shoqërinë.

Paneli i mutacioneve të neurofibromatozës

Neurofibromatoza (NF) është një grup sëmundjesh gjenetike që shkakton rritjen e tumoreve përgjatë nervave të ndryshme dhe ndikon edhe në zhvillimin e indeve jo-nervore si kockat dhe lëkura.

NF1 NF2

Paneli i mutacioneve të gjenit të distrofinës

Distrofia muskulare e Duchenne (DMD) është sëmundja më e shpeshtë e muskujve. Meqenëse shkaktohet nga delecione në gjenin e distrofinës në kromozomin X, shfaqet tek 1 në 3500 djem të porsalindur.

DMD

Paneli i mutacioneve të fibrozës cistike

Fibroza cistike (CF) ekzaminohet me sekuencim të plotë të gjenit.

CFTR

Paneli i sklerozës tuberoze

Kjo sëmundje shkakton më së shpeshti njolla (hamartoma/lloje tumori beninje) në të gjitha organat, veçanërisht në lëkurë, tru dhe veshka.

TSC1 TSC2

Paneli i mutacioneve të sëmundjeve depozituese lizosomale

Sëmundjet lizosomale janë një grup sëmundjesh trashëgimore që prekin dhjetëra mijëra njerëz në mbarë botën. Çdo gjysmë ore lind një fëmijë me sëmundje lizosomale.

GALC NAGA MANBA SMPD1 GLB1 GBA2 GBA HEXB HEXA GNPTAB GUSB ARSA ARSB FUCA1 MAN2B1

Paneli i mutacioneve të sindromës Noonan

Sindroma Noonan (NS) është një sëmundje gjenetike multisistemike autosomale dominante me prevalencë rreth 1/2500. Rreth 50% e rasteve shkaktohen nga mutacione të gjenit PTPN11.

A2ML1 PTPN11 BRAF CBL HRAS KRAS NRAS MAP2K1 MAP2K2 RAF1 RIT1 SHOC2 SOS1 SPRED1

Paneli i mutacioneve të sëmundjes së depozitimit të glikogjenit

Tipi 1 GSD është tipi më i rëndë klinikisht. Pacientët paraqiten në periudhën e foshnjërisë me hipoglicemi, acidozë, vonesë në rritje dhe hepatomegali.

PHKG2 PHKA2 GYS2 G6PC SLC37A4 AGL GBE1 PYGM GYS1 GAA PRKAG2 PYGL GYG1 PGM1 PHKA1 PHKB PGAM2 PFKM ENO3 ALDOA LAMP2

Paneli i mutacioneve të kardiomiopatisë hipertrofike

Kardiomiopatia hipertrofike është një sëmundje trashëgimore (autosomale dominante) me spektër të gjerë simptomash. Meqenëse rreziku i vdekjes së papritur në fëmijëri është më i lartë, diagnoza e hershme është shumë më e rëndësishme.

ACTA2 ACTC1 ACTN2 CALR3 CAV1 CAV3 PRKAG2 SLC2A11 SLC52A2 SLC6A2 SLC12A3 SLC19A2 SLC25A4 SLC22A5 SLC25A20 SLC2A10 TNNC1 TNNI3 TNNT2

Paneli LQT

Sindroma QT e gjatë është një sëmundje e rrallë e karakterizuar nga çrregullimi i ripolarizimit të miokardit pa anomali strukturore të zemrës. Frekuenca vlerësohet në 1/2500-7000.

SCN5A KCNH2 KCNQ1 KCNE2 KCNE1

Paneli i mutacioneve të çrregullimit të glikozilimit

Çrregullimi i glikozilimit është një gjendje trashëgimore që prek shumë pjesë të trupit. Individët e prekur zhvillojnë simptoma zakonisht gjatë foshnjërisë.

ALG1 ALG2 ALG3 ALG6 ALG8 ALG9 ALG12 ALG13 B4GALT1 COG1 COG4 COG5 COG6 COG7 COG8 DOLK DPAGT1 DPM1 DPM3 MGAT2 MOGS MPDU1 MPI PMM2 RFT1 SLC35A1 SLC35C1

Paneli i mutacioneve të humbjes së dëgjimit trashëgimore

Frekuenca e humbjes së dëgjimit është përcaktuar në 1 në 1000 lindje të gjalla. Rreth gjysma e këtij numri i atribuohet shkaqeve gjenetike dhe gjysma tjetër shkaqeve mjedisore.

COL11A1 COL11A2 COL2A1 COL4A3 COL4A4 COL4A5 COL9A1 COL9A2 DFNA5 MYO15A MYO1A MYO3A MYO6 MYO7A DFNB31 DFNB59 GJB2 GJB3 GJB6 KCNQ1 KCNQ4 MYH14 MYH9 SERPINB6 SLC17A8 SLC26A4 SLC26A5 SLC4A11

Paneli i mutacioneve të sindromave të etheve periodike

Shumica e 30 mutacioneve të njohura deri më tani ndodhen në ekzonin 10. Ndryshimet fenotipike lidhen me mutacionet. Mutacioni M694V shoqërohet me fenotip më të rëndë dhe rrezik të lartë amiloidoze.

MEFV TNFRSF1A NLRP3 MVK NOD2 IL1RN IL10RA IL10RB IL10 PSTPIP1 LPIN2 PLCG2

Paneli i mutacioneve Bardet-Biedl

Sindroma Bardet-Biedl (BBS) është një sëmundje gjenetikisht heterogjene e karakterizuar nga obeziteti, distrofia retinale, polidaktilia, malformacionet renale, paaftësia mendore dhe hipogonadizmi.

CCDC28B BBS1 BBS2 BBS10 ARL6 MKKS BBS9 MKS1

Paneli i mutacioneve të distrofisë muskulare Limb-Girdle

Distrofia muskulare Limb-Girdle është një sëmundje e trashëguar autosomale dominante. Sëmundja zhvillohet pas mutacioneve në gjenet MYOT, LMNA, CAV3 dhe DNAJB6.

CAPN3 SGCB SGCA FKRP POMGNT1 DNAJB6 DYSF POMT1 FKTN

Paneli i mutacioneve të ataksisë spinozebelare

Ataksia spinozebelare (SCA) është një sëmundje që shkaktohet nga humbja ose çrregullimi funksional i qelizave të ekuilibrit në tru të vogël dhe palcën e kurrizit.

ATXN7 ATXN1 ATXN10 CACNA1A ATXN3 PPP2R2B ATXN2 TBP STUB1 ELOVL4 SETX KCND3 SPTBN2

Paneli i mutacioneve të sindromës Alport

Sindroma Alport trashëgohet autosomale recesive, autosomale dominante ose X-lidhur recesive. Te 80% e pacientëve vërehen mutacionet COL4A5 të trashëguara X-lidhur.

COL4A5 COL4A4 COL4A3

Paneli i mutacioneve të sindromës Kallmann

Sindroma Kallmann është një nga shkaqet më të rëndësishme të infertilitetit mashkullor. Shfaqet së bashku me hipogonadizmin hipogonadotropik dhe anosminë (paaftësia për të nuhatur).

KAL1 KAL2 XLR RROKR2 PROK2 STS GNRH1

Paneli i dështimit të parakohshëm ovarian

Dështimi i parakohshëm ovarian (POI) është një gjendje e karakterizuar nga amenorrhea para moshës 40-vjeçare, nivele të larta të gonadotropinës dhe nivele të ulëta të estrogjenit. Prevalenca është rreth 1% e grave nën 40 vjeç.

FSHR FIGLA INHA GDF9 NOBOX NR5A1 PDPK1 BMP15 POF1B

Infertiliteti femëror

Shkaku më i shpeshtë gjenetik: anomali kromozomale dhe mutacione në gjenin FMR1 në kromozomin X përgjegjës për sindromën X të brishtë.

FSHB FSHR LHBB LHCGR

Infertiliteti mashkullor

Shkaqet kryesore të infertilitetit mashkullor: anomali të mëdha kromozomale, mikrodelecione të kromozomit Y, fibroza cistike, çrregullimet hormonale dhe disa sindroma gjenetike të rralla.

AZFa: sY86, sY625, M259 / AZFb: sY131, sY127, sY134 / AZFc: sY255, sY157, sY254 — kontrolli: ZFY/ZFX, sY14 (SRY), sY81, sY90

CATSPER1 CFTR LHCGR

Paneli i mutacioneve MODY — 1

GCK HNF1A HNF1B HNF4A

Paneli i mutacioneve MODY — 2

ABCC8 BLK FOXP3 G6PC2 GCK GLIS3 HNF1A HNF1B HNF4A INS PDX1 INSR KCNJ11 KLF11 NEUROD1 NEUROG3 NKX2-2 PAX4 RFX6 ZFP57 HADH GLUD1 SLC16A1

Testi i analizës së sekuencës së plotë të gjenit CFTR

Tek pacientët me fibrozë cistike, AMP ciklike nuk mund të sekretohet nga qelizat epiteliale. Si rrjedhojë, djersa përmban nivel të lartë kripe, zhvillohen sëmundje kronike të mushkërive dhe pamjaftueshmëri pankreatike. 97-98% e burrave me fibrozë cistike kanë azoosperm për shkak të mungesës bilaterale të lindjes së vas deferens (CBAVD).

CFTR

Testi i analizës së sekuencës MEFV

Ethet Mesdhetare Familjare (FMF): Një sëmundje trashëgimore (autosomale recesive) me sulme të përsëritura të etheve, dhimbje barku (peritonit), dhimbje gjoksi (pleurit) dhe dhimbje dhe ënjtje të nyjeve (artrit).

Mutacionet shkaktare gjenden zakonisht në ekzonet 2 dhe 10 të gjenit.

MEFV

Testi i analizës së sekuencës së koneksinës

Individët me mutacionin c.35delG në gjenin GJB2 kanë humbje dëgjimi brenda dhe midis familjeve. Humbja e dëgjimit me incidencë 1-2 në 1000 të porsalindur është çrregullimi shqisor më i shpeshtë.

GJB2

Testi i analizës së fragmentit X të brishtë

Sindroma X e brishtë është shkaku më i shpeshtë trashëgimor i paaftësisë mendore dhe vështirësive në të mësuar. Shkaktohet nga zgjerimi i përsëritjes CGG në gjenin FMR1 në kromozomin X.

FMR1

Paneli i mutacioneve të ADN-së mitokondriale

MtDNA (whole gene)

Shërbimi ynë i Sekuencimit të plotë të Ekzomës (WES)

Për informacione të detajuara rreth shërbimit Whole Exome Sequencing, procesit dhe aplikimit, vizitoni westesti.com.

Shko te westesti.com

Analiza e Sekuencës së Plotë të Ekzomës (WES)

Çfarë është testi i Analizës së Sekuencës së Plotë të Ekzomës (Whole Exome Sequencing — WES)?

ADN-ja përmban rreth 20,000 gjene. Sekuencat që kodifikojnë proteinat e çdo gjeni quhen ekzon; totali i të gjitha ekzoneve në ADN quhet ekzom. Rreth 85% e sëmundjeve gjenetike njerëzore shkaktohen nga ndryshime të ndryshme në rajonet ekzonike. Prandaj, sekuencimi i këtyre rajoneve që përbëjnë vetëm rreth 1% të ADN-së ka rëndësi të madhe diagnostike.

Kujt duhet t'i kryhet analiza e sekuencës së plotë të ekzomës?

  • Raste komplekse ku diagnoza diferenciale me gjetje klinike nuk është e mundur
  • Raste ku testet e linjës së parë nuk dhanë rezultate normale
  • Diagnostikimi i çrregullimeve heterogjene gjenetike dhe fenotipike
  • Familjet me fëmijë të sëmurë që planifikojnë shtatzëni të re

Cilat janë avantazhet e testit WES?

Normat e diagnozës variojnë nga 30-80% në varësi të grupit. Testi WES jep kontribut diagnostik të rëndësishëm për këto sëmundje.

Me përcaktimin e etiologjisë së sëmundjes, mundësitë e trajtimit duhet të rivlerësohen. Gjithashtu, në shtatzënitë e mundshme të familjes, probabiliteti i rikthimit sqarohet.