Эндокринологические и метаболические заболевания

Панели MODY, синдромы MEN и панели наследственного рака

Панель анализа мутаций MODY

MODY (Maturity Onset Diabetes of the Young — диабет зрелого типа у молодых) — редкая форма диабета, отличная от диабета I и II типа. Это аутосомно-доминантное заболевание с низкой распространенностью и генетической гетерогенностью. Оно проявляется до 25 лет, независимо от таких факторов, как этническая группа, питание и вес. Из определенных на сегодняшний день типов рекомендуется исследовать, по порядку, MODY тип 2: GCK (глюкокиназа), MODY тип 3: HNF1A (гепатоцитарный ядерный фактор-1 альфа), MODY тип: HNF4A (ядерный фактор-4-альфа), MODY тип 5: HNF1B (гепатоцитарный ядерный фактор 1 бета).

GCK HNF1A HNF4A HNF1B

Тест секвенирования MEN

Опухоли, приводящие к синдромам множественной эндокринной неоплазии (MEN), происходят из нейроэндокринных APUD-клеток. Все они демонстрируют аутосомно-доминантную передачу. Существует 3 синдрома MEN в дополнение к немедуллярному раку щитовидной железы (MTC). MEN 1 — очень редкое заболевание. Его распространенность составляет от 0,02 до 0,2 на тысячу человек. MEN-1 характеризуется гиперплазией или аденомой паращитовидных желез, поражением островков поджелудочной железы и гипофиза. Другие опухоли, определенные при MEN 1, — это ВИПома, глюкагонома, соматостатинома и ППома. Ген MEN-1 расположен на длинном плече хромосомы 11 и, вероятно, является геном-супрессором опухолей.

MEN1

Панель HBOC (наследственный рак молочной железы и яичников)

50% случаев семейного рака молочной железы обусловлены мутациями гена BRCA. Приблизительно 33% женщин с раком молочной железы, наблюдаемым в возрасте до 30 лет, являются носителями одной из этих мутаций. Рак яичников занимает 5-е место по смертности от рака у женщин. У 5-10% из них есть семейный анамнез, и они часто обусловлены мутациями BRCA1 и BRCA2. У женщин, унаследовавших мутацию от семьи, риск развития рака молочной железы и яичников значительно повышен по сравнению с общей популяцией. При наличии мутации BRCA1 этот риск составляет 85% и 45% для рака молочной железы и рака яичников соответственно; при мутациях BRCA2 наблюдается повышенный риск рака молочной железы, аналогичный мутациям BRCA1, и этот риск составляет 27% для рака яичников.

Пациентам, отрицательным по мутациям гена BRCA, рекомендуется панель HBOC:

ATM BARD1 BRIP1 CDH1 CHEK2 NBN PALB2 PTEN RAD51C RAD51D STK11 TP53

Панель мутаций горячих точек рака

Хотя каждая опухоль имеет свои отличительные характеристики, молекулярные нарушения чаще всего лежат в известных путях. Неизвестные соматические мутации при профилировании типов опухолей встречаются редко. В качестве примера можно привести мутации горячих точек, возникающие в сегментах ДНК, кодирующих определенные белковые домены. Регионы горячих точек очень важны при генетических заболеваниях. Потому что эти регионы являются горячими точками, и показатели мутаций в них намного выше по сравнению с другими регионами. Исследования повторяющихся мутаций в этих регионах могут предоставить нам ценную информацию. Считается, что они могут привести к открытию новых лекарственных методов лечения типов рака.

ABL1 AKT1 ALK APC ATM BRAF CDH1 CDKN2A CSF1R CTNNB1 EGFR ERBB2 ERBB4 EZH2 FBXW7 FGFR1 FGFR2 FGFR3 FLT3 GNA11 GNAS GNAQ HNF1A HRAS IDH1 JAK2 JAK3 IDH2 KDR KIT KRAS MET MLH1 MPL NOTCH1 NPM1 NRAS PDGFRA PIK3CA PTEN PTPN11 RB1 RET SMAD4 SMARCB1 SMO SRC STK11 TP53 VHL

Панель мутаций синдромов семейного рака

Инактивация генов-супрессоров опухолей (TSG) может вызвать предрасположенность к раку и появление синдромов семейного рака. Мутации в TSG передаются последующим поколениям через половые клетки. Эти мутации изначально возникают в зародышевой линии, в сперматозоидах или яйцеклетках, и наследуются человеком, который родится. Не следует забывать, что хотя унаследованный мутировавший TSG вызывает серьезное повышение риска предрасположенности к раку, унаследованный мутировавший TSG не лежит в основе всех семейных раков.

TSG становятся неактивными после возникновения мутаций в обоих аллелях, теряя свои супрессорные эффекты на пролиферацию клеток. Реже две мутации могут наблюдаться в TSG, унаследованном нормально от матери и отца, при жизни, при условии, что они находятся в одной клетке. Однако у человека, который унаследовал одну из мутаций от своей семьи наследственно и несет ее во всех своих клетках, возникновение второй мутации и, как следствие, развитие рака гораздо более вероятно из-за обилия пораженных клеток.

NBN BARD1 CDH1 MRE11A ATM PTEN STK11 RAD51C PALB2 BRIP1 MSH6 RAD51 CHEK2 TP53

Панель первичного иммунодефицита

Отсутствие или функциональное расстройство любого из элементов, составляющих нашу иммунную систему, называется иммунодефицитными заболеваниями. Когда эти заболевания развиваются из-за наследственных или генетических причин, они называются первичным иммунодефицитом (дефицитом иммунной системы). На сегодняшний день определено очень большое количество типов первичного иммунодефицита.

В рамках панели исследуется более 200 генов. Вы можете обратиться в наш центр за полным списком генов.

Панель лихорадочных заболеваний

Что такое семейная средиземноморская лихорадка (СБЛ)?

Это аутосомно-рецессивное наследственное заболевание, характеризующееся повторяющимися приступами лихорадки и воспаления синовиальной оболочки, брюшины или плевры, сопровождающихся болью. Типичны приступы, сопровождающиеся лихорадкой и болью в животе, при которых наблюдается спонтанное выздоровление. Почечная недостаточность из-за амилоидоза является наиболее серьезным осложнением заболевания. Заболевание наблюдается особенно в турецких, армянских, арабских и неашкеназских еврейских общинах. В этих общинах частота заболевания составляет 1/200, а носительство — 1/5. Поскольку его можно перепутать с заболеваниями брюшной полости, генетическая диагностика заболевания предотвратит подвергание пациента ненужным хирургическим операциям.

MDFIC TNFAIP3 TMEM173 PSMA3 PSMB4 PSMB9 IL36RN NLRP3 MVK NOD2 PSTPIP1 TNFRSF1A CARD14 LPIN2 NLRP12 IL10RA CECR1 IL10RB IL10RN PSMB8 ELANE MEFV

Панель наследственного рака толстой кишки

Раки толстой кишки относятся к наиболее распространенным типам рака в мире. По статистике Министерства здравоохранения, рак толстой кишки (толстого кишечника) также входит в 5 наиболее распространенных типов рака в нашей стране. Хотя рак толстой кишки может возникнуть в любом возрасте, чаще всего он наблюдается после 50 лет. При изучении распределения по полу рак толстой кишки занимает второе место среди всех видов рака у женщин и третье — у мужчин.

Человек, в семье которого ранее был колоректальный рак, имеет более высокий риск рака. Наследственные генетические факторы увеличивают соотношение риска. Как семейные аденоматозные полипы в толстом кишечнике, так и наследственный неполипозный колоректальный рак, также известный как синдром Линча, повышают риск рака толстой кишки. Хотя генетические колоректальные раки составляют лишь 5-10% заболеваний, люди, несущие эти генетические факторы, моложе по возрасту начала заболевания, чем другие пациенты с раком толстой кишки, и несут больший жизненный риск.

MLH1 MSH2 MSH6 PMS2 EPCAM TGFBR2 MLH3 APC MUTYH MSH3 NTHL1

Панель солидных опухолей

Услуга полного экзомного секвенирования (WES)

Подробную информацию об услуге полного экзомного секвенирования, процессе и подаче заявки смотрите на westesti.com.

Перейти на westesti.com

Существуют также решения для солидных опухолей и онкогематологии, направленные на предоставление расширенного геномного анализа точными и чувствительными методами на образцах рака. Панели, разработанные для точного обнаружения простых и сложных генетических мутаций из малого количества нуклеиновых кислот, полученных из образцов FFPE, свежей ткани и крови методом секвенирования нового поколения (NGS), позволяют секвенировать ДНК, РНК и ctDNA при различных типах опухолей. Панели на основе ДНК нацелены на типы вариантов SNV, Indel и CNV, тогда как панели на основе РНК выполняют обнаружение слияний (транслокаций) и экспрессии.

Тест молекулярного профилирования при раках у взрослых

  • Тест молекулярного профилирования при раках у взрослых — это таргетный тест секвенирования нового поколения (NGS), позволяющий обнаруживать варианты одного нуклеотида (SNV), изменения числа копий (CNV), генные слияния и инделы по 161 гену.
  • Он выполняет высокоспецифичное профилирование мутаций, анализируя некоторые гены как горячие точки, некоторые — путем секвенирования всей экзомной области, а другие — по изменениям числа копий.
  • Этот тест может быть выполнен всего с 10 нг ДНК или РНК, полученных из образцов, зафиксированных формалином и залитых парафином (FFPE). Это позволяет анализировать даже образцы FFPE с малым количеством материала.
  • Он предлагает уникальный метод для планирования персонализированной диагностики и лечения рака.
  • Он создается в результате анализа мутаций, обнаруженных количественными методами анализа с использованием технологии AmpliSeq, с помощью программного обеспечения Ion Reporter и подготавливается в виде ПЕРСОНАЛИЗИРОВАННОГО ОТЧЕТА.
  • Содержание отчета включает взаимосвязь мутация-лечение, исследования лекарств, клинические испытания и соответствующую литературу.

Анализ опухолевой мутационной нагрузки (TMB)

  • В исследованиях иммуноонкологии; иммуная терапия в настоящее время признана фундаментальным компонентом терапевтических стратегий онкологии.
  • Цель состоит в том, чтобы использовать собственную иммунную систему организма для распознавания, контроля или потенциального устранения рака.
  • Иммуная терапия обладает потенциалом влиять на результат клинического лечения или превращать рак из смертельного заболевания в неугрожающее жизни или хроническое.
  • Опухолевая мутационная нагрузка (TMB), мера количества мутаций в геноме опухоли, — это биомаркер, оцениваемый путем полного экзомного секвенирования (WES). В недавних исследованиях она показывает высокую согласованность с WES.
  • Опухолевая мутационная нагрузка измеряет биомаркеры и объясняет состояние взаимосвязи между TMB и будущим терапевтическим ответом при различных видах рака.